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據(jù)悉,這是全由中國科學家在大豆的故鄉(xiāng)--中國完成的一項大型大豆基因組課題,突破了*國家在大豆研究的壟斷。
香港中文大學、華大基因研究院、*、*等單位合作的“大豆回家”項目,在大豆基因組研究取得重大突破。*次為大豆基因組學研究提供了全面的重測序數(shù)據(jù),對未來的大豆群體遺傳學研究,分子標記育種,新基因的發(fā)現(xiàn)奠定了堅實的基礎(chǔ)。
據(jù)悉,這是全由中國科學家在大豆的故鄉(xiāng)--中國完成的一項大型大豆基因組課題,突破了*國家在大豆研究的壟斷。
該研究對野生大豆和栽培大豆全基因組進行了大規(guī)模遺傳多態(tài)性分析,為大豆的遺傳學研究提供了非常有價值的資源,為大豆種質(zhì)資源保護和分子育種帶來新的科學啟示。研究人員運用新一代測序技術(shù)對17株野生大豆和14株栽培大豆進行了全基因組重測序,利用SOAP軟件v2.18比對到大豆的參考基因組上,總共發(fā)現(xiàn)了630多萬個單核苷酸多態(tài)性位點(SNPs),建立了高密度的分子標記圖譜。同時通過SOAPdenovo軟件分別對野生大豆和栽培大豆進行組裝,從而鑒定出了18萬多個兩種大豆中獲得和缺失變異(PAVs),得到了在栽培大豆中獲得以及丟失的基因。
研究人員發(fā)現(xiàn)了大豆基因組不同于其他作物植物的兩個顯著特點:存在較高程度的基因連鎖不平衡和較高比例的單核苷酸非同義替換/同義替換比例,這提示在大豆育種方面,分子標記育種比基因圖位克隆可能會擁有更多的優(yōu)勢。這些發(fā)現(xiàn)為大豆的遺傳學研究以及分子育種提供了重要的多態(tài)性標記,同時也補充了大豆的基因集,為大豆基因組的進一步研究提供了大量的寶貴數(shù)據(jù)。研究人員還發(fā)現(xiàn),與栽培大豆相比,野生大豆有著更高水平的遺傳多樣性,這表明人類的選擇對栽培大豆的遺傳多樣性產(chǎn)生了很大的影響,導致了狹窄的生物多樣性,對可持續(xù)種植帶來負面影響。而對野生大豆的分析表明,隨著野生大豆生存環(huán)境的減少,野生大豆的有效群體大小在減少,這表明了野生種質(zhì)資源保存的重要性和緊迫性。
此外,研究人員還分析了大豆基因組中基因連鎖不平衡位點及分布,鑒定了20多萬個標簽SNPs,這些工作將有利于數(shù)量性狀位點分析及相關(guān)研究。
大豆是中國和亞洲地區(qū)的重要傳統(tǒng)作物,蘊含豐富營養(yǎng)價值,是提供食糧和飼料的重要經(jīng)濟作物。大豆亦是一種對環(huán)境十分友善的作物,每年以每公頃100公斤的效率把大氣中的氮氣轉(zhuǎn)化到土壤之中,令植物可以吸收,適合應用在輪作、連作和套作等可持續(xù)發(fā)展農(nóng)業(yè)模式中。由于中國及世界的農(nóng)耕地面積及淡水資源不斷萎縮,令大豆等作物的產(chǎn)量難以滿足人口上升而日益增加的需求。因此,有效利用邊緣土地作為種植用途成為優(yōu)先課題。
來源:農(nóng)民日報
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